Formatieren alleine reicht nicht, für solche Fälle gibt es spezielle Lösch-tools, die schreiben die ganze Platte mehrmals nacheinander mit Müll zu. Dann kann man auch nix mehr wiederherstellen.
Ich würd die Platten generell komplett plattmachen und dann einfach Win2000 frisch drauf installieren, erstens ist dann der Rechner wieder wie neu, ohne Altlasten, und zweitens kann man so nix übersehen.
Win98 kannste dir sparen, das OS ist 10 Jahre alt, braucht kein Schwein mehr.